2024年，涩谷街头发生一起身份不明的青年制造的凶杀案，打破了都市的平静。作为周刊杂志撰稿人的主人公碧，在追踪报道过程中，意外发现案件中嫌疑人的特征竟与自己的高中同学高度吻合。这突如其来的认知，让碧不得不重新联系那些早已疏远、多年未见的伙伴们。随着调查的深入，碧发现这起案件并非孤立的暴力事件，其背后牵连着高中时代一段被所有人刻意淡忘的过往。曾经亲密无间的同窗，如今各自怀揣秘密，在重逢的尴尬与试探中，记忆的碎片逐渐拼合。每个人都在用沉默保护自己，却又在无意间暴露裂痕。“透明的我们”既指现代社会中人与人之间看似亲近实则疏离的状态，也指向那些被隐藏的自我。当凶手的身份越来越清晰，碧必须面对一个残酷的问题：当年那个被大家忽视的同学，究竟是如何走上这条不归路的？而他们所有人，是否也在无形中成为了共谋？一段关于青春、赎罪与重新认知真相的故事就此展开。